Spiritueel gezien is de bruine agaat een troostende en beschermende steen, zijn rustgevende energie helpt mensen die eenzaam zijn, rouwen vanwege een verlies, moeilijke tijden doormaken of gekwetst zijn. De zachte energie van deze steen is geweldig voor meditatie. Deze steen trilt op een langzamere frequentie dan de meeste edelstenen, maar zijn energie moet de eigenschappen versterken en stabiliseren. Het is een goede steen voor het balanceren van emoties, harmonisatie, het stimuleren van intellectuele en fysieke energie.